申玉菲并非三体人。虽然她在《三体》系列中扮演重要角色，但根据中的描写，申玉菲是地球人，而非三体人。她的行为表现与三体人有所不同，她是一个聪明、勇敢且富有同情心的人类科学家，致力于保护地球和人类的利益。虽然在中有关申玉菲的背景信息相对较少，但没有确凿证据表明她是三体人。因此，在目前的情况下，我们可以得出结论：申玉菲不是三体人。

申玉菲是地球三体组织拯救派的代表人物，主要目标是帮助三体人实现在三体星存在的正确方式，拯救他们的星球。在地球三体组织与三体人接触的过程中，逐渐发现了三体星球随时被恒星吞噬的事实。于是三体组织当中的一部分人开始对三体人产生了同情，并希望找到方法帮他们拯救星球，这些人形成了后来的拯救派，申玉菲就是代表人物。

申玉菲确实是刘慈欣《三体》系列中的人物。申玉菲暗地里是地球三体组织（ETO）成员，也就是地球反叛军成员，对于地球人类来说是敌对关系。申玉菲在ETO内属于拯救派，在了解三体文明的生存环境后，对他们抱有宗教感情，拯救派没有降临派那么极端，他们的最终理想就是拯救三体文明。

申玉菲虽然是地球三体人，但是她主张的是拯救，并不是所谓的占有和破坏，为此，她和降临派的潘寒矛盾日益加剧，潘寒主张降临占有，认为申玉菲的行为，严重的阻挠了三体人的降临，对她越发的不满，从最新的剧情中可以看出，潘寒已经决定对申玉菲下手了，如果不是统帅叶文洁的庇佑的话，申玉菲在火车上恐怕就已经被杀了。